Развитие основных направлений научных исследований в заповеднике осуществляется в соответствии с Менеджмент-планом, в основу которого положена Севильская стратегия и «Мадридский план действий (2008-2013)», призванные обеспечить работу заповедника как биосферного резервата с интеграцией в социально-экономическую структуру региона..
Основные тематические направления научной деятельности:
ТЕМА I
Динамика явлений и процессов в природном комплексе заповедника
Проведение исследований по программе "Летопись природы”
Раздел 1.1. Территория. Регистрация изменений территории заповедника и охранной зоны.
1.1.1. Рельеф. Геоморфологическая характеристика территории заповедника Раздел 1.2. Почвы. Разнообразие, физико-химические свойства, природная динамика
Раздел 1.3. Гидрологический режим территории
1.3.1. Гидрохимия осадков Раздел 1.4. Погодные условия и микроклимат
Раздел 1.5. Флора и растительность
1.5.1. Сезонная динамика растительных сообществ
1.5.2. Сукцессионные процессы растительных сообществ заповедника
1.5.2.1. Влияние ветровалов на динамику растительных сообществ
1.5.2.2. Влияние процессов заболачивания на структуру и динамику растительных сообществ
1.5.2.3. Пространственно-временная динамика лесных сообществ на гарях Раздел 1.6. Фауна и животное население
1.6.1. Видовой состав фауны и её изменения
1.6.1.1. Численность и распределение населения птиц по основным типам местообитаний
1.6.2. Динамика численности хозяйственно ценных и редких видов фауны в заповеднике, охранной зоне и ТОП.
1.6.3. Экологические обзоры основных охраняемых видов фауны
1.6.4. Структура и численность популяций фоновых и индикаторных видов животных
1.6.4.1. Мышевидные грызуны и землеройки
1.6.4.2. Наземные беспозвоночные Раздел 1.7. Календарь природы (общая фенология). Оценка урожайности основных плодоносящих видов растений и шляпочных грибов. Характеристика распределения грибов по основным типам леса. Раздел 1.8. Наблюдения на эталонных площадях
Раздел 1.9. Коллекционный фонд млекопитающих
Раздел 1.10. Соблюдение заповедного режима
Раздел 1.11.
Историческая география охраняемой территории
ТЕМА II
Структура, динамика и функционирование экосистем южной тайги и их мониторинг
Раздел 2.1. Структура ландшафтов заповедника и охранной зоны
Раздел 2.2. Динамика растительности массовых ветровалов
Раздел 2.3. Структурно-функциональная организация сообществ и популяций мелких млекопитающих: оценка, диагностика и прогнозирование состояния экосистем
ТЕМА III
Сохранение и оценка биоразнообразия. Рациональное использование ресурсов региона.
Раздел 3.1. Структура и динамика фенофонда основных охраняемых видов животных (как показатель состояния популяций)
Раздел 3.2. Структура и динамика популяционных группировок хищных млекопитающих и их жертв как показатель состояния экосистем
Раздел 3.3. Пространственно-временная динамика размещения крупных млекопитающих в зоне южной тайги на охраняемой территории (Центрально-Лесной заповедник).
ТЕМА IV
Научные основы деятельности заповедника. Разработка методов использования ГИС-технологий и средств дистанционного зондирования
Раздел 4.1. Методическое обеспечение работ по оценке природных комплексов заповедника для долгосрочного хранения многолетних данных
Раздел 4.2. Научное обоснование, заповедно-режимных, лесохозяйственных, научно-технических и биотехнических мероприятий
Раздел 4.3. Информационное обеспечение деятельности в области экологического просвещения и образования
ТЕМА V
Содействие выполнению международных договоров и конвенций
Раздел 5.1. Сеть биосферных резерватов ЮНЕСКО
Раздел 5.2. Конвенция о трансграничном переносе загрязняющих веществ
Раздел 5.3. Рамсарская конвенция
За более чем 70 летний период существования Центрально-Лесного заповедника сложились богатые традиции ведения научно-исследовательской работы. На всем протяжении функционирования для заповедника характерны широкие кооператорские связи с ведущими научными центрами нашей страны.
Так, в 1967 г. был организован стационар Ботанического института им. В. Л. Комарова РАН под руководством проф. В. Г. Карпова. Основной акцент в его работе сделан на изучении видового состава, структуры и продуктивности еловых лесов. Эти исследования получили мировую известность.
Заповедник стал традиционным местом проведения полевых практик факультетов почвоведения и географии МГУ им. М.В. Ломоносова. С 1972 в заповеднике функционирует постоянно действующий стационар факультета почвоведения МГУ.
Долгие партнерские отношения у заповедника и с другими крупными научными учреждениями, такими как Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН, Институт географии РАН, Санкт-Петербургская государственная лесотехническая академия им. С.М. Кирова и другими.
В 1963 году в Центрально-Лесном заповеднике была организована метеорологическая станция. С 1988 года на ее базе начала работать станция комплексного фонового мониторинга, которая проводила наблюдения за поступлением загрязняющих веществ, вызванные в т.ч. трансграничным переносом. Благодаря этому заповедник располагает многолетними рядами фонового состояния окружающей среды центра Европейской части России.
За последние 30 лет на территории заповедника проводили исследования специалисты более чем 20 научно-исследовательских учреждений и ВУЗов страны. Ежегодно осуществляют научные исследования 15 научных коллективов, на долговременной основе реализуется комплексные, в том числе международные проекты, при этом существует выраженная тенденция ежегодного роста интенсивности научных исследований. С 90-х годов началось активное международное сотрудничество. В течение пяти лет (1992-1997) на базе Центрально-Лесного заповедника выполнялась Программа Российско-Германского сотрудничества в рамках реализации программы комплексного экосистемного глобального мониторинга. В настоящее время реализуется проект Евросоюза по изучению углеродного баланса в экосистемах.
Заповедник – участник сети EMEP по слежению за трансграничным переносом загрязненных воздушных масс, а также работает в рамках проекта ICP Forest. Центрально-Лесной заповедник входит в число 36 биосферных резерватов России.
На территории заповедника существует сеть стационарных объектов, позволяющая проводить многолетние комплексные исследования. Начиная с 1969 года, действуют первые пробные площади, заложенные Ботаническим институтом. Наблюдения на них продолжаются до сих пор. На сегодняшний день система постоянных пробных площадей насчитывает 94 единицы. Из них 11 включены в панъевропейскую сеть EuroMAB.
С 1985 года мониторинговые исследования проводятся в Центрально-Лесном заповеднике по принятым в международной сети биосферных резерватов унифицированным методикам.
За время работы научного отдела накоплен богатый научный фонд, в котором собраны труды сотрудников, чья исследовательская деятельность была связана с изучением природных комплексов и процессов на заповеданной территории. Они отражены в многочисленных (более 1000) печатных работах, в том числе в 13 монографиях и сборниках.
С 1970 г. сотрудниками заповедника защищено 13 кандидатских и 2 докторских диссертации. По материалам, собранным на территории заповедника сотрудниками и аспирантами сторонних учреждений, защищено более 30 кандидатских диссертаций.
